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成都军区机关医院 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市
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喀什地区第一人民医院 新疆维吾尔自治区喀什地区
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和田市人民医院 新疆维吾尔自治区和田地区
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04新疆和静县人民医院 新疆维吾尔自治区巴音郭楞蒙古自治州
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05塔城市人民医院 新疆维吾尔自治区塔城地区
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06阜康准东石油医院 新疆维吾尔自治区昌吉回族自治州
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07鲁中冶金矿业集团职工医院 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市
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08新疆医科大学第六附属医院 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市
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09焉耆县人民医院 新疆维吾尔自治区巴音郭楞蒙古自治州
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10头屯河区中心医院 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市
排名依据
医院排名依次参考如下资料：
(1) 复旦大学医院管理研究所《中国医院及专科声誉排行榜》
(2) 政府卫生部门评定的临床重点专科和教育部门评定的重点学科分布
(3) 医院对应科室的高级职称人数
(4) 医院对应科室的床位数