相关标志物的建议、推荐级别及强度见下表
1. 雌激素受体（Oestrogen receptor ，ER）和孕激素受体（progesterone receptor ，PR）
ER、PR 的主要临床意义是判断患者是否可接受内分泌治疗。通过对 20 个大型临床试验进行 Meta 分析发现，ER（+）的患者接受5年他莫昔芬治疗，可降低 39% 的 15 年内疾病复发率，降低 30% 的乳腺癌死亡率，而 ER（-）的患者无论是否使用他莫昔芬，15 年内疾病复发率和乳腺癌死亡率都无差别。
在此项 Meta 分析中未提及 PR 的预测作用，但有其他报道称高水平的 PR 表达可以提高患者对他莫昔芬的疾病响应概率，促进他莫昔芬延长转移性乳腺癌患者的总生存期。
2. 人类表皮生长因子受体 2（human epidermal growth factor receptor 2，HER2 ）
HER2 的主要临床意义是判断是否可使用抗 HER2 治疗，目前针对 HER2（+）的患者，有四种抗 HER2 疗法：曲妥珠单抗，拉帕替尼，帕妥珠单抗和 T-DM1 。
HER2（+）的进展期乳腺癌患者一线治疗可紫杉烷类药物联合曲妥珠单抗或帕妥珠单抗；使用一线疗法进展后可选择 T-DM1、拉帕替尼。
3. Ki67
Ki67 的临床意义是判断肿瘤恶性程度。标记的是处于增殖周期中的细胞，阳性率越高，肿瘤生长越快，组织分化越差，对化疗也越敏感，但 Ki67 表达水平与化疗疗效之间的关系并不十分明确，一般来说，Ki67 阳性率＞25%，乳腺癌患者会有较高的死亡风险。
4. 尿激酶型纤溶酶原激活物（urokinase-type plasminogen activator，uPA）和纤溶酶原激活物抑制物-1（plasminogen activator inhibitor-1，PAI-1）
uPA 和 PAI-1 是目前最佳的判断乳腺癌患者预后及指导治疗的指标之一，特别是淋巴结阴性的乳腺癌患者。对于 ER 强阳性的乳腺癌患者，PAI-1 高表达者比低表达者的预后差。
Hurd 等认为，uPA、尿激酶型纤溶酶原激活物受体（urokinase-type plasminogen activator receptor，uPAR）和 PAI-1 在低级别和高级别导管原位癌中均有表达，而 uPA/uPAR 共表达能帮助识别有潜在浸润转移特性的导管原位癌。
另外，关于晚期乳腺癌的研究则提示，高表达 uPA 和 PAI-1 的肿瘤对一线三苯氧胺治疗的反应性较差，从而降低了无进展生存率，对尿激酶系统指标的测定有助于从激素受体阳性乳腺癌患者中区分出预后更差者，从而采取更积极的治疗以提高患者的生存率。
5. Oncotype DX
乳腺癌 OncotypeDX 检测利用手术中获得的肿瘤组织，检测其中的乳腺癌相关基因和参考基因（共 21 个），利用创建好的公式进行计算，最终得到一个复发指数（RS），该指数介于 0 到 100 之间。
RS<18 时为低度复发风险，18≤RS<31 为中度复发风险，RS≥31 为高度复发风险，十年远处转移率分别为 6.8%、14.3% 和 31%。低 RS 说明乳腺癌恶性程度低，对激素疗法敏感，化疗获益小；高 RS 说明乳腺癌恶性程度高，对激素疗法不敏感，化疗获益大。
6. MammaPrint
利用 DNA 微阵列技术检测乳腺癌患者的基因表达信号，有 70 个基因表达信号能够准确反映乳腺癌远处转移情况，可以将患者分为低危和高危两组，低危的早期乳腺癌患者可以安全的不予化疗，高危的早期乳腺癌患者化疗获益最多。可以较准确地区分不需要化疗可长期生存的患者，从而避免过度治疗。
7. Prosigna
采用 Nanostring 技术定量检测 50 个基因的 mRNA 表达，经过一些管家基因的标准化和阴性与阳性对照的比对，计算出病人 RS。该指数介于 0 到 100 之间。RS<40 时为低度复发风险，41≤RS<60 为中度复发风险，RS≥61 为高度复发风险.
8. EndoPredict
EndoPredict（EPclin）是另一种乳腺癌风险预测手段，通过整合 8 个基因特征以及肿瘤大小和淋巴结状态得出综合预后信息，预测 ER+/HER2- 乳腺癌患者未来 10 年转移风险。EPclin 将患者分为低危和高危两组，只建议高危组患者接受化疗。
9. 乳腺癌指数（breast cancer index,BCI）
BCI 是一个以 RT-PCR 为基础的多基因检测方法，主要用来预测ER阳性、淋巴结阴性乳腺癌的远处复发风险。BCI 评分包括 2 个部分，一个预后因子是 2 个基因 HOXB13/IL17BR 表达的比例，另一个决定因素是一个 5 个增殖相关基因的评分。可以识别出 35%~45% 的病人存在较高的晚期复发风险，这些病人可能获益于延长的辅助治疗。
题图来源：123RF图库
