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新疆医科大学第一附属医院 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市
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新疆医科大学第二附属医院 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市
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新疆生产建设兵团医院 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市
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04昌吉回族自治州人民医院 新疆维吾尔自治区昌吉回族自治州
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05巴州人民医院 新疆维吾尔自治区巴音郭楞蒙古自治州
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06新疆医科大学第五附属医院 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市
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07博尔塔拉蒙古自治州人民医院 新疆维吾尔自治区博尔塔拉蒙古自治州
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08中国人民解放军新疆军区总医院 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市
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09新疆维吾尔自治区人民医院 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市
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10克拉玛依市中心医院 新疆维吾尔自治区克拉玛依市
排名依据
医院排名依次参考如下资料：
(1) 复旦大学医院管理研究所《中国医院及专科声誉排行榜》
(2) 政府卫生部门评定的临床重点专科和教育部门评定的重点学科分布
(3) 医院对应科室的高级职称人数
(4) 医院对应科室的床位数