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独山子石化医院 新疆维吾尔自治区克拉玛依市
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莎车县人民医院 新疆维吾尔自治区喀什地区
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石油天然气公司职工总医院 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市
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04托里县人民医院 新疆维吾尔自治区伊犁哈萨克自治州
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05解放军第十二医院 新疆维吾尔自治区喀什地区
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06新疆第二济困医院 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市
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07新疆兵团农一师阿拉尔医院 新疆维吾尔自治区阿克苏地区
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08阿勒泰市人民医院 新疆维吾尔自治区伊犁哈萨克自治州
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09兵团农七师一三Ｏ团医院 新疆维吾尔自治区克拉玛依市
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10伊宁县人民医院 新疆维吾尔自治区伊犁哈萨克自治州
排名依据
医院排名依次参考如下资料：
(1) 复旦大学医院管理研究所《中国医院及专科声誉排行榜》
(2) 政府卫生部门评定的临床重点专科和教育部门评定的重点学科分布
(3) 医院对应科室的高级职称人数
(4) 医院对应科室的床位数