南京市高淳人民医院始建于1936年，经过七十余年的艰苦创业，目前已成为本地区规模最大、功能齐全、优势突出，集医疗、教学、科研、急救、预防保健于一体的综合性二级甲等医院，是卫生部临床路径推进定点医院、南京市“基本现代化医院”、江苏省和南京市文明单位、江苏省首批“实施患者安全目标合格医院”、全国院务公开示范点。
　　医院核定床位820张，实际开放床位1100张，年门诊量达75万多人次，年出院4万人次，手术1.5万多人次。配备有瓦里安直线加速器、1.5T磁共振、64排螺旋CT、大型DSA、乳房钼靶X光机等一大批先进医疗设备，建有虚拟化技术局域网系统，信息化建设和管理处于全省同级医院领先地位。近年，医院学科建设不断发展壮大，妇产科、急诊科、重症医学科、神经内科、神经外科、眼科、病理科、医学影像科（超声）、肿瘤科、耳鼻咽喉科、普外科 、麻醉科、检验科、医学影像科（放射）等14个专科是南京市重点专科，肾内科、皮肤科、骨科、内分泌科、肿瘤内科等一批特色专科在高淳及周边地区享有盛誉。
　　2012年2月，位于高淳经济开发区，占地138.7亩的新区医院一期工程竣工验收并正式启用，首批开放床位400张。新区医院按照“三级医院”标准建设，设有温馨现代的产科病房、VIP产房，国际标准的新生儿监护病房（NICU）等，已迁入科室有：泌尿外科、肾内科、肿瘤外科、肿瘤内科、骨科、产科、血液透析室、急诊科以及放射科、检验科、超声科等医技科室。2014年1月，二期工程竣工验收并正式启用，目前开设康复医学科、感染性疾病科。2014年10月肿瘤放疗中心正式启用，医院整合人力、技术等资源，按一院二区管理模式，对老区和新区医院进行一体化运作。
　　医院是扬州大学医学院、江苏建康职业学院附属医院，南京医科大学、江苏大学的教学医院，江苏省老科技工作者协会卫生分会技术合作医院。同时，医院与第三军医大学大坪医院、南京鼓楼医院、江苏省人民医院，以及美国Adoocat集团霍普金斯儿童医院、意大利都灵BOSCO医院等国内、国际一流医院建立了技术合作关系。医院于2005年通过ISO9001质量管理体系的认证，曾连续十五年蝉联南京市“白求恩杯”竞赛第一名，多次获南京市“医院管理年”活动第一名，2014年12月，医院再次高分通过南京市二级甲等医院复审。