复旦大学附属儿科医院创建于1952年，系卫生部部署三级甲等医院，是集医、教、研为一体的综合性儿童专科医院，是全国儿科学重点学科、国家“211工程”和“985”工程建设单位，是最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授权点、临床医学（儿科学组）博士后流动站的单位。在中国最佳医院专科排行榜中，综合排名首次居全国儿童医院榜首，儿内科继续名列第一，儿外科继续名列第二。多次被评为上海市文明单位。
　　医院宗旨：一切为了孩子。医院使命：建树医学典范，呵护儿童健康。医院定位：立足上海、服务全国、辐射亚洲。医院愿景：亚洲一流的儿童医学中心，儿科医学教育向全国辐射的中心，中外儿科学术交流的重要桥梁。医院院训：团结、奋进、严谨、创新。医院理念：尊重、平等、热情、关爱。
　　在各级政府的大力支持和关心下，2008年2月29日，座落于闵行区万源路399号的新医院经过将近4年的建设正式启用，医院主体从枫林路搬迁至新医院，原址保留普通儿内科门诊服务功能，以满足周边地区病人的需求。新医院占地153亩，Ⅰ期建筑面积8万多平方米，核定床位由原来的330张增至600张，现开放床位711张。截止2013年底，职工1396人，博士生导师30名，硕士生导师33名，高级职称专家118人。
　　医院开放床位71张，年门急诊服务量逾221万，出院病人突破3.5万人次，住院手术近1.6万。医院专业设置齐全，共设45个临床医技科室，新生儿、重症医学科、小儿消化科、中医儿科、新生儿疾病重点实验室、小儿外科、临床护理被确定为国家临床重点专科。新生儿、外科、心血管、传染病等专业曾先后被列为卫生部临床学科重点专业。新生儿科是上海市医学重点学科，儿科学是上海市重中之重重点学科，小儿外科是上海市小儿外科疑难重症临床医学中心，呼吸急救专业是上海市医学领先专业。
　　医院科研实力雄厚，近10年来承担470项科研课题，经费2亿元。包括国家自然科学基金重点课题、卫生部临床学科重点专业、国家“863”、“973”、“十一五”、“十二五”科技支撑计划等重要项目。
　　2012年医院启动“腾飞计划”（1125人才工程），利用985创新平台、重大科技项目或海外特聘教授岗位等吸引海外著名学者来院开展科研合作，先后引入21位国内外知名教授作为双聘PI。医院有2个省部级重点实验室，分别为卫生部新生儿疾病重点实验室和上海市出生缺陷防治重点实验室。
　　复旦大学上海医学院儿科学系设在儿科医院，每年承担七个专业400余名医学生的临床教学与实习培养。已为全国各地培养进修医生6000余名，每年培养长期进修学员200余名，每年培养短期参观学习学员200余名。每年举办近30-40期国家级继续教育学习班。做为上海市住院医师规范化培养基地，每年培养30余名住院医师，2012年做为上海市专科医师培养基地开始进行专科医师规范化的培养。每年培养博士研究生20余名，硕士研究生40余名.
　　医院每年接待外宾讲学、交流100余次。医院先后与美国、加拿大等国家的20多个国际上知名的医学机构和国内20多个单位建立密切协作关系。医院平均每年主办3次大型儿科国际学术会议，近两年分别成功主办孤独症研究国际合作发展论坛、第43届太平洋小儿外科年会、第16届国际儿科肾脏病大会。
　　近11年来(2003年-2013年)获学科建设和科研项目共计286项，其中国家级课题121项，SCI收录论文550篇（近4年来295篇），获省部级以上奖项28项。并出版《实用新生儿学》、《小儿感染病学》、《现代实用儿科学》等十余部重要专著。主办《中国儿科循证杂志》进入国家核心期刊，并与美国儿科学会协作主办《Pediatrics中文版》。
　　儿科人以“一切为了孩子”为宗旨，以“团结、奋进、严谨、创新”的院训勉励自己，贯穿“以人为本”的服务理念，构建和谐稳定的医院文化，营造规范有序的良好氛围，在全国享有较高的声誉。